Echantillonneur à injection de fluide automatique - AFIS

Les microorganismes sont les catalyseurs de pratiquement tous les cycles biogéochimiques sur cette planète. Par conséquent, les connaissances sur les abondances, les diversités et les activités microbiennes dans l'environnement sont d'un intérêt fondamental non seulement pour les microbiologistes, mais aussi pour la compréhension des cycles d'éléments importants à l'échelle mondiale. Une approche indépendante de la culture pour déduire ces fonctions métaboliques des procaryotes est d'analyser les métatranscriptomes.
L'échantillonneur à injection de fluide automatique AFIS fournit une nouvelle technique pour améliorer la technologie d'échantillonnage afin d'étudier les processus biogéochimiques microbiens dans l'environnement par l'analyse des métatranscriptomes (ARN messager).Les transcripts se dégradent rapidement - dans un temps voisin de quelques secondes à quelques minutes. On sait que leurs profils d'abondance détectés dans la nature sont sujets à des modifications considérables non seulement en raison de changements environnementaux, mais simplement à la suite de procédures d'échantillonnage. L'échantillonnage traditionnel à partir d'un navire à l'aide de bouteilles d'échantillonnage d'eau conventionnelles prend habituellement plusieurs minutes à plusieurs heures, ce qui laisse beaucoup de temps disponible pour les modifications, donc les erreurs.
Pour remédier à ce problème, l'AFIS prélève des échantillons et fixe rapidement l'eau directement dans l'environnement initial et conserve instantanément le profil d'expression génique in situ. Cela permet une évaluation fiable des processus microbiens basés sur la métatranscriptomique.
D'autres applications sont attendues dans le domaine de l'échantillonnage d'eau conventionnel où la fixation immédiate de matières biologiques ou de substances chimiques à l'intérieur de l'échantillon est nécessaire.
La version à bouteille unique AFISsingle a été conçue pour fonctionner à l'intérieur de systèmes d'échantillonnage d'eau de rosette communes ou comme instrument autonome lorsqu'il est monté sur des câbles hydrographiques ou d'autres structures submersibles comme des plateformes benthiques, ROVS etc.